ועד המסלקה מסלקת הבנקים (להלן "המסלקה") מנוהלת על ידי ועד המסלקה, המונה 14 חברים, שממנה נגיד בנק ישראל או מי שהוסמך על ידו. מחצית מהחברים הם מקרב עובדי בנק ישראל, ומחציתם - מהמערכת הבנקאית. כל חברי המסלקה פועלים על פי "כללי המסלקה" (הידועים בשמם הקודם - "תקנות המסלקה"), אשר נקבעים על ידי ועד המסלקה. ועד המסלקה מתכנס בהתאם לצורך, ומפרסם אחת לשנה דוח על פעילותו. תפקידו העיקרי של ועד המסלקה הוא הסדרה של העברת הממסרים והסליקות בין הבנקים.